{rfName}
Ge

Indexat a

Citacions

13

Altmetrics

Anàlisi d'autories institucional

Bancic, JAutor (correspondència)

Compartir

18 d’gener de 2025
Publicacions
>
Article
No

Genomic selection for genotype performance and stability using information on multiple traits and multiple environments

Publicat a: THEORETICAL AND APPLIED GENETICS. 136 (5): 104- - 2023-05-01 136(5), DOI: 10.1007/s00122-023-04305-1

Autors:

Bancic, J; Ovenden, B; Gorjanc, G; Tolhurst, D J
[+]

Afiliacions

NSW Dept Primary Ind, Wagga Wagga, NSW, Australia - Autor o coautor
Univ Edinburgh, Roslin Inst, Easter Bush, Midlothian, Scotland - Autor o coautor
Univ Edinburgh, Royal Dick Sch Vet Studies, Easter Bush, Midlothian, Scotland - Autor o coautor
Veure més

Resum

Key message The inclusion of multiple traits and multiple environments within a partially separable factor analytic approach for genomic selection provides breeders with an informative framework to utilise genotype by environment by trait interaction for efficient selection. This paper develops a single-stage genomic selection (GS) approach which incorporates information on multiple traits and multiple environments within a partially separable factor analytic framework. The factor analytic linear mixed model is an effective method for analysing multi-environment trial (MET) datasets, but has not been extended to GS for multiple traits and multiple environments. The advantage of using all information is that breeders can utilise genotype by environment by trait interaction ( GETI) to obtain more accurate predictions across correlated traits and environments. The partially separable factor analytic linear mixed model (SFA-LMM) developed in this paper is based on a three- way separable structure, which includes a factor analytic matrix between traits, a factor analytic matrix between environments and a genomic relationship matrix between genotypes. A diagonal matrix is then added to enable a different genotype by environment interaction (GEI) pattern for each trait and a different genotype by trait interaction (GTI) pattern for each environment. The results show that the SFA-LMM provides a better fit than separable approaches and a comparable fit to non-separable and partially separable approaches. The distinguishing feature of the SFA-LMM is that it will include fewer parameters than all other approaches as the number of genotypes, traits and environments increases. Lastly, a selection index is used to demonstrate simultaneous selection for overall performance and stability. This research represents an important continuation in the advancement of plant breeding analyses, particularly with the advent of high-throughput datasets involving a very large number of genotypes, traits and environments.
[+]

Paraules clau

CropGenomeGenomicsGenotypeModels, geneticPhenotypePlant breedingSelection, geneticSeriesVariety

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista THEORETICAL AND APPLIED GENETICS a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2023, es trobava a la posició 14/126, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Agronomy.

Independentment de l'impacte esperat determinat pel canal de difusió, és important destacar l'impacte real observat de la pròpia aportació.

Segons les diferents agències d'indexació, el nombre de citacions acumulades per aquesta publicació fins a la data 2026-04-04:

  • WoS: 4
  • Europe PMC: 2
[+]

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2026-04-04:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 55.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 55 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 16.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 28 (Altmetric).
[+]

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Australia; United Kingdom.

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (Bancic, Jon) .

l'autor responsable d'establir les tasques de correspondència ha estat Bancic, Jon.

[+]

Reconeixements vinculats a l’ítem

JB was funded by Scotland's Rural College (SRUC) through a PhD studentship Research Excellence Grant. The Australian Rice Breeding Program is funded under the Australian Rice Partnership II project, a partnership between NSW Department of Primary Industries, AgriFutures and SunRice. GG was funded by the BBSRC ISP grant BBS/E/D/30002275 to The Roslin Institute and the BBSRC grant BB/R019940/1.
[+]