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Genomic Analysis of Terpene Synthase Family and Functional Characterization of Seven Sesquiterpene Synthases from Citrus sinensis

Publicado en:Frontiers In Plant Science. 8 1481- - 2017-08-24 8(), DOI: 10.3389/fpls.2017.01481

Autores: Alquezar, Berta; Rodriguez, Ana; de la Pena, Marcos; Pena, Leandro

Afiliaciones

Univ Politecn Valencia - Autor o Coautor

Resumen

Citrus aroma and flavor, chief traits of fruit quality, are derived from their high content in essential oils of most plant tissues, including leaves, stems, flowers, and fruits. Accumulated in secretory cavities, most components of these oils are volatile terpenes. They contribute to defense against herbivores and pathogens, and perhaps also protect tissues against abiotic stress. In spite of their importance, our understanding of the physiological, biochemical, and genetic regulation of citrus terpene volatiles is still limited. The availability of the sweet orange (Citrus sinensis L. Osbeck) genome sequence allowed us to characterize for the first time the terpene synthase (TPS) family in a citrus type. CsTPS is one of the largest angiosperm TPS families characterized so far, formed by 95 loci from which just 55 encode for putative functional TPSs. All TPS angiosperm families, TPS-a, TPS-b, TPS-c, TPS-e/f, and TPS-g were represented in the sweet orange genome, with 28, 18, 2, 2, and 5 putative full length genes each. Additionally, sweet orange beta-farnesene synthase, (Z)-beta-cubebene/alpha-copaene synthase, two beta-caryophyllene synthases, and three multiproduct enzymes yielding beta-cadinene/alpha-copaene, beta-elemene, and beta-cadinene/ledene/allo-aromandendrene as major products were identified, and functionally characterized via in vivo recombinant Escherichia coli assays.

Palabras clave
Bacterial expressionBeta-caryophylleneBiosynthesisBound volatile compoundsCdna isolationCitrusDefenseDiaphorina-citriDown-regulationFruit aromasGene familyMolecular-cloningMonoterpeneMonoterpene synthaseOrangeSesquiterpeneVolatileΒ-caryophyllene

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Frontiers In Plant Science debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2017, se encontraba en la posición 24/223, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Plant Sciences.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir de las Citas Mundiales proporcionadas por WoS (ESI, Clarivate), arroja un valor para la normalización de citas relativas a la tasa de citación esperada de: 2.15. Esto indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: ESI 14 Nov 2024)

Esta información viene reforzada por otros indicadores del mismo tipo, que aunque dinámicos en el tiempo y dependientes del conjunto de citaciones medias mundiales en el momento de su cálculo, coinciden en posicionar en algún momento al trabajo, entre el 50% más citados dentro de su temática:

  • Media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 2.68 (fuente consultada: FECYT Feb 2024)
  • Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions: 7.5 (fuente consultada: Dimensions Apr 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-04-24, el siguiente número de citas:

  • WoS: 47
  • Scopus: 55
  • Europe PMC: 27
  • OpenCitations: 53
Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-04-24:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 112.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 112 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 1.
  • El número de menciones en la red social Facebook: 2 (Altmetric).
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 1 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Brazil.

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (Alquézar García, Berta) y Último Autor (Pena, L).

el autor responsable de establecer las labores de correspondencia ha sido Pena, L.