{rfName}
Th

Llicència i ús

Licencia Icono OpenAccess

Altmetrics

Impacte en els Objectius de Desenvolupament Sostenible (ODS)

Anàlisi d'autories institucional

Belda, EAutor o coautor

Compartir

11 d’octubre de 2024
Publicacions
>
Article
Hybrid Gold

The great tit HapMap project: a continental-scale analysis of genomic variation in a songbird

Publicat a: Molecular Ecology Resources. 24 (5): e13969- - 2024-01-01 24(5), DOI: 10.1111/1755-0998.13969

Autors:

Spurgin, L.G.; Bosse, M.; Adriaensen, Frank; Albayrak, T; Barboutis, C.; Belda, EJ ; Bushuev,A.; Cecere, J.G.; Charmantier, Anne; Cichon, M.; Dingemanse, N. J.; Doliglez, Blandine; Eeva, Tapio; Erikstad, K.E.; Fedorov, V.
[+]

Afiliacions

Anglia Ruskin Univ, Dept Life Sci, Behav Ecol Grp, Cambridge - Autor o coautor
Babes Bolyai Univ, Hungarian Dept Biol & Ecol, Evolutionary Ecol Grp - Autor o coautor
Bulgarian Acad Sci, Inst Biodivers & Ecosyst Res, Bulgarian Ornithol Ctr - Autor o coautor
Dokuz Eylul Univ, Buca Fac Educ Math & Sci Educ, Biol Educ - Autor o coautor
Eotvos Lorand Univ, Dept Systemat Zool & Ecol, Behav Ecol Grp - Autor o coautor
FRAM High North Res Ctr Climate & Environm, Norwegian Inst Nat Res - Autor o coautor
Hasselt Univ, Interuniv Inst Biostat & Stat Bioinformat - Autor o coautor
Hellenic Ornithol Soc, BirdLife Greece - Autor o coautor
Ist Super Protez & Ric Ambientale ISPRA, Area Avifauna Migratrice - Autor o coautor
Jagiellonian Univ, Inst Environm Sci - Autor o coautor
LMU Munchen, Fac Biol, Behav Ecol - Autor o coautor
Lomonosov Moscow State Univ, Fac Biol - Autor o coautor
Lomonosov Moscow State Univ, Fac Biol, Zvenigorod Biol Stn - Autor o coautor
Max Planck Inst Biol Intelligence, Dept Ornithol - Autor o coautor
Netherlands Inst Ecol NIOO KNAW, Dept Anim Ecol - Autor o coautor
Palacky Univ, Fac Sci, Dept Zool - Autor o coautor
Univ Antwerp, Dept Biol, Evolutionary Ecol Grp - Autor o coautor
Univ Bern, Inst Ecol & Evolut, Evolutionary Ecol Lab - Autor o coautor
Univ Coimbra, Fac Sci & Technol, Dept Life Sci, MARE Marine & Environm Sci Ctr - Autor o coautor
Univ Exeter, Ctr Ecol & Conservat - Autor o coautor
Univ Glasgow, Sch Biodivers One Hlth & Vet Med - Autor o coautor
Univ Groningen, Groningen Inst Evolutionary Life Sci GELIFES - Autor o coautor
Univ Helsinki, Zool Unit, Finnish Museum Nat Hist - Autor o coautor
Univ Milan, Dipartimento Sci & Polit Ambientali - Autor o coautor
Univ Montpellier, CNRS, IRD, CEFE,EPHE - Autor o coautor
Univ Nat Resources & Life Sci, Inst Wildlife Biol & Game Management - Autor o coautor
Univ Nevada - Autor o coautor
Univ Oslo, Ctr Ecol & Evolutionary Synth CEES, Dept Biosci - Autor o coautor
Univ Oulu, Dept Ecol & Genet - Autor o coautor
Univ Oxford, Edward Grey Inst, Dept Biol - Autor o coautor
Univ Padua, Dept Biol - Autor o coautor
Univ Politecn Valencia, Inst Invest Gestio Integrada Zones Costaneres, Campus Gandia - Autor o coautor
Univ Sheffield, Sch Biosci - Autor o coautor
Univ Tartu, Dept Zool - Autor o coautor
Univ Turku, Dept Biol - Autor o coautor
Uppsala Univ, Anim Ecol Evolutionary Biol Ctr, Dept Ecol & Evolut - Autor o coautor
Vrije Univ Amsterdam, Anim Ecol Grp, Dept Ecol Sci - Autor o coautor
Wageningen Univ & Res, Anim Breeding & Genom - Autor o coautor
Yamashina Inst Ornithol - Autor o coautor
Veure més

Resum

A major aim of evolutionary biology is to understand why patterns of genomic diversity vary within taxa and space. Large-scale genomic studies of widespread species are useful for studying how environment and demography shape patterns of genomic divergence. Here, we describe one of the most geographically comprehensive surveys of genomic variation in a wild vertebrate to date; the great tit (Parus major) HapMap project. We screened ca 500,000 SNP markers across 647 individuals from 29 populations, spanning similar to 30 degrees of latitude and 40 degrees of longitude - almost the entire geographical range of the European subspecies. Genome-wide variation was consistent with a recent colonisation across Europe from a South-East European refugium, with bottlenecks and reduced genetic diversity in island populations. Differentiation across the genome was highly heterogeneous, with clear 'islands of differentiation', even among populations with very low levels of genome-wide differentiation. Low local recombination rates were a strong predictor of high local genomic differentiation (FST), especially in island and peripheral mainland populations, suggesting that the interplay between genetic drift and recombination causes highly heterogeneous differentiation landscapes. We also detected genomic outlier regions that were confined to one or more peripheral great tit populations, probably as a result of recent directional selection at the species' range edges. Haplotype-based measures of selection were related to recombination rate, albeit less strongly, and highlighted population-specific sweeps that likely resulted from positive selection. Our study highlights how comprehensive screens of genomic variation in wild organisms can provide unique insights into spatio-temporal evolutionary dynamics.
[+]

Paraules clau

AdaptationBirdsClimate-changeDifferentiationDivergenceEcological geneticsEvolutionGene flowGenomics/proteomicsIslandsLandscapeLife below waterMolecular evolutionNatural-populationsPopulation geneticsPopulation genetics - empiricalSelectionSpeciation

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Molecular Ecology Resources a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2024 encara no hi ha indicis calculats, però el 2023, es trobava a la posició 21/200, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Ecology. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Independentment de l'impacte esperat determinat pel canal de difusió, és important destacar l'impacte real observat de la pròpia aportació.

Segons les diferents agències d'indexació, el nombre de citacions acumulades per aquesta publicació fins a la data 2026-04-02:

  • WoS: 5
  • Scopus: 5
[+]

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2026-04-02:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 60.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 59 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 12.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 5 (Altmetric).
  • El nombre de mencions a mitjans de comunicació: 1 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

Seguint amb l'impacte social del treball, és important destacar el fet que, pel seu contingut, pot ser assignat a la línia d'interès de ODS 14 - Life below water, amb una probabilitat del 66% segons l'algoritme mBERT desenvolupat per Aurora University.
[+]

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Austria; Belgium; Bulgaria; Czech Republic; Estonia; Finland; France; Germany; Greece; Hungary; Italy; Japan; Netherlands; Norway; Oman; Poland; Portugal; Russia; Sweden; Switzerland; Turkey; United Kingdom; United States of America.

[+]