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Impacto en los Objetivos de Desarrollo Sostenible (ODS)

Investigadores/as Institucionales

Belda, EAutor o Coautor

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11 de octubre de 2024
Publicaciones
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Artículo
Hybrid Gold

The great tit HapMap project: a continental-scale analysis of genomic variation in a songbird

Publicado en: Molecular Ecology Resources. 24 (5): e13969- - 2024-01-01 24(5), DOI: 10.1111/1755-0998.13969

Autores:

Spurgin, L.G.; Bosse, M.; Adriaensen, Frank; Albayrak, T; Barboutis, C.; Belda, EJ ; Bushuev,A.; Cecere, J.G.; Charmantier, Anne; Cichon, M.; Dingemanse, N. J.; Doliglez, Blandine; Eeva, Tapio; Erikstad, K.E.; Fedorov, V.
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Afiliaciones

Anglia Ruskin Univ, Dept Life Sci, Behav Ecol Grp, Cambridge - Autor o Coautor
Babes Bolyai Univ, Hungarian Dept Biol & Ecol, Evolutionary Ecol Grp - Autor o Coautor
Bulgarian Acad Sci, Inst Biodivers & Ecosyst Res, Bulgarian Ornithol Ctr - Autor o Coautor
Dokuz Eylul Univ, Buca Fac Educ Math & Sci Educ, Biol Educ - Autor o Coautor
Eotvos Lorand Univ, Dept Systemat Zool & Ecol, Behav Ecol Grp - Autor o Coautor
FRAM High North Res Ctr Climate & Environm, Norwegian Inst Nat Res - Autor o Coautor
Hasselt Univ, Interuniv Inst Biostat & Stat Bioinformat - Autor o Coautor
Hellenic Ornithol Soc, BirdLife Greece - Autor o Coautor
Ist Super Protez & Ric Ambientale ISPRA, Area Avifauna Migratrice - Autor o Coautor
Jagiellonian Univ, Inst Environm Sci - Autor o Coautor
LMU Munchen, Fac Biol, Behav Ecol - Autor o Coautor
Lomonosov Moscow State Univ, Fac Biol - Autor o Coautor
Lomonosov Moscow State Univ, Fac Biol, Zvenigorod Biol Stn - Autor o Coautor
Max Planck Inst Biol Intelligence, Dept Ornithol - Autor o Coautor
Netherlands Inst Ecol NIOO KNAW, Dept Anim Ecol - Autor o Coautor
Palacky Univ, Fac Sci, Dept Zool - Autor o Coautor
Univ Antwerp, Dept Biol, Evolutionary Ecol Grp - Autor o Coautor
Univ Bern, Inst Ecol & Evolut, Evolutionary Ecol Lab - Autor o Coautor
Univ Coimbra, Fac Sci & Technol, Dept Life Sci, MARE Marine & Environm Sci Ctr - Autor o Coautor
Univ Exeter, Ctr Ecol & Conservat - Autor o Coautor
Univ Glasgow, Sch Biodivers One Hlth & Vet Med - Autor o Coautor
Univ Groningen, Groningen Inst Evolutionary Life Sci GELIFES - Autor o Coautor
Univ Helsinki, Zool Unit, Finnish Museum Nat Hist - Autor o Coautor
Univ Milan, Dipartimento Sci & Polit Ambientali - Autor o Coautor
Univ Montpellier, CNRS, IRD, CEFE,EPHE - Autor o Coautor
Univ Nat Resources & Life Sci, Inst Wildlife Biol & Game Management - Autor o Coautor
Univ Nevada - Autor o Coautor
Univ Oslo, Ctr Ecol & Evolutionary Synth CEES, Dept Biosci - Autor o Coautor
Univ Oulu, Dept Ecol & Genet - Autor o Coautor
Univ Oxford, Edward Grey Inst, Dept Biol - Autor o Coautor
Univ Padua, Dept Biol - Autor o Coautor
Univ Politecn Valencia, Inst Invest Gestio Integrada Zones Costaneres, Campus Gandia - Autor o Coautor
Univ Sheffield, Sch Biosci - Autor o Coautor
Univ Tartu, Dept Zool - Autor o Coautor
Univ Turku, Dept Biol - Autor o Coautor
Uppsala Univ, Anim Ecol Evolutionary Biol Ctr, Dept Ecol & Evolut - Autor o Coautor
Vrije Univ Amsterdam, Anim Ecol Grp, Dept Ecol Sci - Autor o Coautor
Wageningen Univ & Res, Anim Breeding & Genom - Autor o Coautor
Yamashina Inst Ornithol - Autor o Coautor
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Resumen

A major aim of evolutionary biology is to understand why patterns of genomic diversity vary within taxa and space. Large-scale genomic studies of widespread species are useful for studying how environment and demography shape patterns of genomic divergence. Here, we describe one of the most geographically comprehensive surveys of genomic variation in a wild vertebrate to date; the great tit (Parus major) HapMap project. We screened ca 500,000 SNP markers across 647 individuals from 29 populations, spanning similar to 30 degrees of latitude and 40 degrees of longitude - almost the entire geographical range of the European subspecies. Genome-wide variation was consistent with a recent colonisation across Europe from a South-East European refugium, with bottlenecks and reduced genetic diversity in island populations. Differentiation across the genome was highly heterogeneous, with clear 'islands of differentiation', even among populations with very low levels of genome-wide differentiation. Low local recombination rates were a strong predictor of high local genomic differentiation (FST), especially in island and peripheral mainland populations, suggesting that the interplay between genetic drift and recombination causes highly heterogeneous differentiation landscapes. We also detected genomic outlier regions that were confined to one or more peripheral great tit populations, probably as a result of recent directional selection at the species' range edges. Haplotype-based measures of selection were related to recombination rate, albeit less strongly, and highlighted population-specific sweeps that likely resulted from positive selection. Our study highlights how comprehensive screens of genomic variation in wild organisms can provide unique insights into spatio-temporal evolutionary dynamics.
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Palabras clave

AdaptationBirdsClimate-changeDifferentiationDivergenceEcological geneticsEvolutionGene flowGenomics/proteomicsIslandsLandscapeLife below waterMolecular evolutionNatural-populationsPopulation geneticsPopulation genetics - empiricalSelectionSpeciation

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Molecular Ecology Resources debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2024 aún no existen indicios calculados, pero en 2023, se encontraba en la posición 21/200, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Ecology. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.

Independientemente del impacto esperado determinado por el canal de difusión, es importante destacar el impacto real observado de la propia aportación.

Según las diferentes agencias de indexación, el número de citas acumuladas por esta publicación hasta la fecha 2026-04-02:

  • WoS: 5
  • Scopus: 5
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Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2026-04-02:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 60.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 59 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 12.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 5 (Altmetric).
  • El número de menciones en medios de comunicación: 1 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

Siguiendo con el impacto social del trabajo, es importante enfatizar el hecho de que, por su contenido, puede ser asignado a la línea de interés del ODS 14 - Conservar y utilizar sosteniblemente los océanos, los mares y los recursos marinos, con una probabilidad del 66% según el algoritmo mBERT desarrollado por Aurora University.
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Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Austria; Belgium; Bulgaria; Czech Republic; Estonia; Finland; France; Germany; Greece; Hungary; Italy; Japan; Netherlands; Norway; Oman; Poland; Portugal; Russia; Sweden; Switzerland; Turkey; United Kingdom; United States of America.

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Objetivos del proyecto

A continuación, se presentan los objetivos perseguidos en la aportación científica analizada:

- Analizar la variación genómica a escala continental en la especie Parus major mediante un muestreo geográficamente extenso.
- Evaluar la estructura genética y los patrones de diversidad genómica en múltiples poblaciones distribuidas a lo largo de gran parte del rango geográfico europeo.
- Determinar la influencia de la historia demográfica, como colonizaciones recientes y cuellos de botella, en la diversidad genética observada.
- Caracterizar la heterogeneidad en la diferenciación genómica, identificando regiones con altos niveles de divergencia (islas de diferenciación) y su relación con tasas locales de recombinación.
- Detectar regiones genómicas fuera de lo común y eventos de selección direccional específicos de poblaciones periféricas.
- Relacionar medidas haplotípicas de selección con la tasa de recombinación para identificar barridos selectivos poblacionales.
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Resultados más relevantes

RESULTADOS MÁS RELEVANTES

El estudio presenta un análisis exhaustivo de la variación genómica en el herrerillo común (Parus major) a escala continental, abarcando gran parte de su distribución europea. Los principales resultados científicos obtenidos son:

- La variación genómica a nivel genómico respalda una colonización reciente de Europa desde un refugio en el sureste europeo, con cuellos de botella y reducción de diversidad genética en poblaciones insulares.
- La diferenciación genómica es altamente heterogénea, identificándose “islas de diferenciación” incluso entre poblaciones con bajos niveles de diferenciación genómica global.
- Las bajas tasas locales de recombinación se asocian fuertemente con altos niveles de diferenciación genómica (FST), especialmente en poblaciones insulares y periféricas del continente.
- Se detectaron regiones genómicas con valores atípicos restringidas a poblaciones periféricas, probablemente resultado de selección direccional reciente en los bordes del área de distribución.
- Medidas basadas en haplotipos indicaron barridos selectivos específicos de poblaciones vinculados a la selección positiva, con una relación moderada con la tasa de recombinación.
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