{rfName}
To

Indexat a

Llicència i ús

Citacions

17

Altmetrics

Grant support

We thank M Rosa Rodriguez-Goberna and the IBMCP Metabolomics Platform for technical help with HPLC analyses, Kristyna Flokova for the support with ABA measurements, Ernesto Llamas for providing the pGWB417_AtPRK construct, Rodrigo Therezan and Lazaro E. P. Peres (USP, Brazil) for the tomato ccd7 line, and Albert Ferrer and Laura Gutierrez for the pDE-Cas9 (with kanamycin resistance) plasmid. This work was funded by grants from Spanish MCIN/AEI/10.13039/501100011033 and European NextGeneration EU/PRTR and PRIMA programs to MR-C (PID2020-115810GB-I00 and UToPIQ-PCI2021-121941). Funding was also provided by Generalitat Valenciana (PROMETEU/2021/056 and AGROALNEXT/2022/067). ME received a predoctoral fellowship from MCIN/AEI (BES-2017-080652) and an EMBO Scientific Exchange Grant (9315).

Anàlisi d'autories institucional

Perez-Perez, JuliaAutor o coautorLison, PurificacionAutor o coautorLopez-Gresa, M PilarAutor o coautor

Compartir

Publicacions
>
Article

Tomato geranylgeranyl diphosphate synthase isoform 1 is involved in the stress-triggered production of diterpenes in leaves and strigolactones in roots

Publicat a:New Phytologist. 239 (6): 2292-2306 - 2023-09-01 239(6), DOI: 10.1111/nph.19109

Autors: Ezquerro, Miguel; Li, Changsheng; Perez-Perez, Julia; Burbano-Erazo, Esteban; Barja, M Victoria; Wang, Yanting; Dong, Lemeng; Lison, Purificacion; Lopez-Gresa, M Pilar; Bouwmeester, Harro J; Rodriguez-Concepcion, Manuel

Afiliacions

UAB, IRTA, UB, Ctr Res Agr Genom CRAG,CSIC, Barcelona 08193, Spain - Autor o coautor
Univ Amsterdam, Swammerdam Inst Life Sci, Green Life Sci Cluster, Plant Hormone Biol Grp, Sci Pk 904, NL-1098 XH Amsterdam, Netherlands - Autor o coautor
Univ Politecn Valencia, CSIC, Inst Plant Mol & Cell Biol IBMCP, Valencia 46022, Spain - Autor o coautor

Resum

Carotenoids are photoprotectant pigments and precursors of hormones such as strigolactones (SL). Carotenoids are produced in plastids from geranylgeranyl diphosphate (GGPP), which is diverted to the carotenoid pathway by phytoene synthase (PSY). In tomato (Solanum lycopersicum), three genes encode plastid-targeted GGPP synthases (SlG1 to SlG3) and three genes encode PSY isoforms (PSY1 to PSY3). Here, we investigated the function of SlG1 by generating loss-of-function lines and combining their metabolic and physiological phenotyping with gene co-expression and co-immunoprecipitation analyses. Leaves and fruits of slg1 lines showed a wild-type phenotype in terms of carotenoid accumulation, photosynthesis, and development under normal growth conditions. In response to bacterial infection, however, slg1 leaves produced lower levels of defensive GGPP-derived diterpenoids. In roots, SlG1 was co-expressed with PSY3 and other genes involved in SL production, and slg1 lines grown under phosphate starvation exuded less SLs. However, slg1 plants did not display the branched shoot phenotype observed in other SL-defective mutants. At the protein level, SlG1 physically interacted with the root-specific PSY3 isoform but not with PSY1 and PSY2. Our results confirm specific roles for SlG1 in producing GGPP for defensive diterpenoids in leaves and carotenoid-derived SLs (in combination with PSY3) in roots.

Paraules clau

Abscisic acid (aba)ArabidopsisArchitectureBiosynthesisCarotenoidCarotenoidsDiterpenesDroughEthyleneFarnesyltranstransferaseGeranylgeranyl diphosphate (ggpp)Geranylgeranyl-diphosphate geranylgeranyltransferaseGr24 strigolactoneLeaf senescenceMetabolismParasitic plantsPhytoene synthasePlant leavesProtein isoformsSolanum lycopersicumStrigolactoneStrigolactones

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista New Phytologist a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2023, es trobava a la posició 11/265, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Plant Sciences. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Des d'una perspectiva relativa, i tenint en compte l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir de les Citacions Mundials proporcionades per WoS (ESI, Clarivate), proporciona un valor per a la normalització de citacions relatives a la taxa de citació esperada de: 1.24. Això indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: ESI 14 Nov 2024)

Aquesta informació es reforça amb altres indicadors del mateix tipus, que encara que dinàmics en el temps i dependents del conjunt de citacions mitjanes mundials en el moment del seu càlcul, coincideixen a posicionar en algun moment el treball, entre el 50% més citats dins de la seva temàtica:

  • Mitjana Ponderada de l'Impacte Normalitzat de l'agència Scopus: 1.54 (font consultada: FECYT Febr 2024)
  • Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions: 3.77 (font consultada: Dimensions Jun 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-06-17, el següent nombre de cites:

  • WoS: 6
  • Scopus: 8
  • Europe PMC: 3
  • OpenCitations: 3

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-06-17:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 20.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 20 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 33.85.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 25 (Altmetric).
  • El nombre de mencions a mitjans de comunicació: 2 (Altmetric).

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Netherlands.

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (Ezquerro, Miguel) i Últim Autor (Rodriguez-Concepcion, Manuel).

l'autor responsable d'establir les tasques de correspondència ha estat Rodriguez-Concepcion, Manuel.