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Grant support

We thank M Rosa Rodriguez-Goberna and the IBMCP Metabolomics Platform for technical help with HPLC analyses, Kristyna Flokova for the support with ABA measurements, Ernesto Llamas for providing the pGWB417_AtPRK construct, Rodrigo Therezan and Lazaro E. P. Peres (USP, Brazil) for the tomato ccd7 line, and Albert Ferrer and Laura Gutierrez for the pDE-Cas9 (with kanamycin resistance) plasmid. This work was funded by grants from Spanish MCIN/AEI/10.13039/501100011033 and European NextGeneration EU/PRTR and PRIMA programs to MR-C (PID2020-115810GB-I00 and UToPIQ-PCI2021-121941). Funding was also provided by Generalitat Valenciana (PROMETEU/2021/056 and AGROALNEXT/2022/067). ME received a predoctoral fellowship from MCIN/AEI (BES-2017-080652) and an EMBO Scientific Exchange Grant (9315).

Análisis de autorías institucional

Perez-Perez, JuliaAutor o CoautorLison, PurificacionAutor o CoautorLopez-Gresa, M PilarAutor o Coautor

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Artículo

Tomato geranylgeranyl diphosphate synthase isoform 1 is involved in the stress-triggered production of diterpenes in leaves and strigolactones in roots

Publicado en:New Phytologist. 239 (6): 2292-2306 - 2023-09-01 239(6), DOI: 10.1111/nph.19109

Autores: Ezquerro, Miguel; Li, Changsheng; Perez-Perez, Julia; Burbano-Erazo, Esteban; Barja, M Victoria; Wang, Yanting; Dong, Lemeng; Lison, Purificacion; Lopez-Gresa, M Pilar; Bouwmeester, Harro J; Rodriguez-Concepcion, Manuel

Afiliaciones

UAB, IRTA, UB, Ctr Res Agr Genom CRAG,CSIC, Barcelona 08193, Spain - Autor o Coautor
Univ Amsterdam, Swammerdam Inst Life Sci, Green Life Sci Cluster, Plant Hormone Biol Grp, Sci Pk 904, NL-1098 XH Amsterdam, Netherlands - Autor o Coautor
Univ Politecn Valencia, CSIC, Inst Plant Mol & Cell Biol IBMCP, Valencia 46022, Spain - Autor o Coautor

Resumen

Carotenoids are photoprotectant pigments and precursors of hormones such as strigolactones (SL). Carotenoids are produced in plastids from geranylgeranyl diphosphate (GGPP), which is diverted to the carotenoid pathway by phytoene synthase (PSY). In tomato (Solanum lycopersicum), three genes encode plastid-targeted GGPP synthases (SlG1 to SlG3) and three genes encode PSY isoforms (PSY1 to PSY3). Here, we investigated the function of SlG1 by generating loss-of-function lines and combining their metabolic and physiological phenotyping with gene co-expression and co-immunoprecipitation analyses. Leaves and fruits of slg1 lines showed a wild-type phenotype in terms of carotenoid accumulation, photosynthesis, and development under normal growth conditions. In response to bacterial infection, however, slg1 leaves produced lower levels of defensive GGPP-derived diterpenoids. In roots, SlG1 was co-expressed with PSY3 and other genes involved in SL production, and slg1 lines grown under phosphate starvation exuded less SLs. However, slg1 plants did not display the branched shoot phenotype observed in other SL-defective mutants. At the protein level, SlG1 physically interacted with the root-specific PSY3 isoform but not with PSY1 and PSY2. Our results confirm specific roles for SlG1 in producing GGPP for defensive diterpenoids in leaves and carotenoid-derived SLs (in combination with PSY3) in roots.

Palabras clave

Abscisic acid (aba)ArabidopsisArchitectureBiosynthesisCarotenoidCarotenoidsDiterpenesDroughEthyleneFarnesyltranstransferaseGeranylgeranyl diphosphate (ggpp)Geranylgeranyl-diphosphate geranylgeranyltransferaseGr24 strigolactoneLeaf senescenceMetabolismParasitic plantsPhytoene synthasePlant leavesProtein isoformsSolanum lycopersicumStrigolactoneStrigolactones

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista New Phytologist debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2023, se encontraba en la posición 11/265, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Plant Sciences. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir de las Citas Mundiales proporcionadas por WoS (ESI, Clarivate), arroja un valor para la normalización de citas relativas a la tasa de citación esperada de: 1.24. Esto indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: ESI 14 Nov 2024)

Esta información viene reforzada por otros indicadores del mismo tipo, que aunque dinámicos en el tiempo y dependientes del conjunto de citaciones medias mundiales en el momento de su cálculo, coinciden en posicionar en algún momento al trabajo, entre el 50% más citados dentro de su temática:

  • Media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 1.54 (fuente consultada: FECYT Feb 2024)
  • Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions: 3.77 (fuente consultada: Dimensions Jun 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-06-17, el siguiente número de citas:

  • WoS: 6
  • Scopus: 8
  • Europe PMC: 3
  • OpenCitations: 3

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-06-17:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 20.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 20 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 33.85.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 25 (Altmetric).
  • El número de menciones en medios de comunicación: 2 (Altmetric).

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Netherlands.

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (Ezquerro, Miguel) y Último Autor (Rodriguez-Concepcion, Manuel).

el autor responsable de establecer las labores de correspondencia ha sido Rodriguez-Concepcion, Manuel.