{rfName}
Se

Indexat a

Llicència i ús

Icono OpenAccess

Citacions

32

Altmetrics

Anàlisi d'autories institucional

Casto-Rebollo, CAutor o coautorBlasco, AAutor o coautorIbáñez-Escriche, NAutor (correspondència)

Compartir

Publicacions
>
Article

Selection for environmental variance shifted the gut microbiome composition driving animal resilience

Publicat a:Microbiome. 11 (1): 147- - 2023-07-04 11(1), DOI: 10.1186/s40168-023-01580-4

Autors: Casto-Rebollo, Cristina; Argente, Maria Jose; Garcia, Maria Luz; Pena, Ramona Natacha; Blasco, Agustin; Ibanez-Escriche, Noelia

Afiliacions

Miguel Hernandez Univ, Ctr Invest & Innovac Agroalimentaria & Agroambient - Autor o coautor
Univ Lleida, AGROTECNIO Ctr, Dept Ciencia Anim, Lleida - Autor o coautor
Univ Politecn Valencia, Inst Anim Sci & Technol - Autor o coautor

Resum

Background Understanding how the host's microbiome shapes phenotypes and participates in the host response to selection is fundamental for evolutionists and animal and plant breeders. Currently, selection for resilience is considered a critical step in improving the sustainability of livestock systems. Environmental variance (V-E), the within-individual variance of a trait, has been successfully used as a proxy for animal resilience. Selection for reduced V-E could effectively shift gut microbiome composition; reshape the inflammatory response, triglyceride, and cholesterol levels; and drive animal resilience. This study aimed to determine the gut microbiome composition underlying the V-E of litter size (LS), for which we performed a metagenomic analysis in two rabbit populations divergently selected for low (n = 36) and high (n = 34) V-E of LS. Partial least square-discriminant analysis and alpha- and beta-diversity were computed to determine the differences in gut microbiome composition among the rabbit populations. Results We identified 116 KEGG IDs, 164 COG IDs, and 32 species with differences in abundance between the two rabbit populations studied. These variables achieved a classification performance of the V-E rabbit populations of over than 80%. Compared to the high V-E population, the low V-E (resilient) population was characterized by an underrepresentation of Megasphaera sp., Acetatifactor muris, Bacteroidetes rodentium, Ruminococcus bromii, Bacteroidetes togonis, and Eggerthella sp. and greater abundances of Alistipes shahii, Alistipes putredinis, Odoribacter splanchnicus, Limosilactobacillus fermentum, and Sutterella, among others. Differences in abundance were also found in pathways related to biofilm formation, quorum sensing, glutamate, and amino acid aromatic metabolism. All these results suggest differences in gut immunity modulation, closely related to resilience. Conclusions This is the first study to show that selection for V-E of LS can shift the gut microbiome composition. The results revealed differences in microbiome composition related to gut immunity modulation, which could contribute to the differences in resilience among rabbit populations. The selection-driven shifts in gut microbiome composition should make a substantial contribution to the remarkable genetic response observed in the V-E rabbit populations.

Paraules clau

AlistipesAnimalAnimal experimentAnimalsArticleBacteriaBacteroidesBacteroidetesBiofilmCholesterolCholesterol levelControlled studyEggerthellaEnvironmentFecesFirmicutesGastrointestinal microbiomeGeneticsGenomeInflammationInflammatory bowel diseaseIntestine floraKeggLachnospiraceaeLactobacillusLeporidaeMegasphaeraMetagenomeMicrobiotaMicrofloraNonhumanOdoribacter splanchnicusPhenotypePrincipal component analysisRabbitsRuminococcusTriacylglycerolUlcerative colitisVariance

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Microbiome a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2023, es trobava a la posició 8/161, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Microbiology. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Des d'una perspectiva relativa, i tenint en compte l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir de les Citacions Mundials proporcionades per WoS (ESI, Clarivate), proporciona un valor per a la normalització de citacions relatives a la taxa de citació esperada de: 2.33. Això indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: ESI 14 Nov 2024)

Aquesta informació es reforça amb altres indicadors del mateix tipus, que encara que dinàmics en el temps i dependents del conjunt de citacions mitjanes mundials en el moment del seu càlcul, coincideixen a posicionar en algun moment el treball, entre el 50% més citats dins de la seva temàtica:

  • Mitjana Ponderada de l'Impacte Normalitzat de l'agència Scopus: 1.82 (font consultada: FECYT Febr 2024)
  • Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions: 7.51 (font consultada: Dimensions Jun 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-06-14, el següent nombre de cites:

  • WoS: 12
  • Scopus: 12
  • Europe PMC: 8
  • OpenCitations: 11

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-06-14:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 25.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 25 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 15.93.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 14 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (CASTO REBOLLO, CRISTINA) i Últim Autor (IBAÑEZ ESCRICHE, NOELIA).

l'autor responsable d'establir les tasques de correspondència ha estat IBAÑEZ ESCRICHE, NOELIA.