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Casto-Rebollo, CAutor o CoautorBlasco, AAutor o CoautorIbáñez-Escriche, NAutor (correspondencia)Selection for environmental variance shifted the gut microbiome composition driving animal resilience
Publicado en:Microbiome. 11 (1): 147- - 2023-07-04 11(1), DOI: 10.1186/s40168-023-01580-4
Autores: Casto-Rebollo, Cristina; Argente, Maria Jose; Garcia, Maria Luz; Pena, Ramona Natacha; Blasco, Agustin; Ibanez-Escriche, Noelia
Afiliaciones
Resumen
Background Understanding how the host's microbiome shapes phenotypes and participates in the host response to selection is fundamental for evolutionists and animal and plant breeders. Currently, selection for resilience is considered a critical step in improving the sustainability of livestock systems. Environmental variance (V-E), the within-individual variance of a trait, has been successfully used as a proxy for animal resilience. Selection for reduced V-E could effectively shift gut microbiome composition; reshape the inflammatory response, triglyceride, and cholesterol levels; and drive animal resilience. This study aimed to determine the gut microbiome composition underlying the V-E of litter size (LS), for which we performed a metagenomic analysis in two rabbit populations divergently selected for low (n = 36) and high (n = 34) V-E of LS. Partial least square-discriminant analysis and alpha- and beta-diversity were computed to determine the differences in gut microbiome composition among the rabbit populations. Results We identified 116 KEGG IDs, 164 COG IDs, and 32 species with differences in abundance between the two rabbit populations studied. These variables achieved a classification performance of the V-E rabbit populations of over than 80%. Compared to the high V-E population, the low V-E (resilient) population was characterized by an underrepresentation of Megasphaera sp., Acetatifactor muris, Bacteroidetes rodentium, Ruminococcus bromii, Bacteroidetes togonis, and Eggerthella sp. and greater abundances of Alistipes shahii, Alistipes putredinis, Odoribacter splanchnicus, Limosilactobacillus fermentum, and Sutterella, among others. Differences in abundance were also found in pathways related to biofilm formation, quorum sensing, glutamate, and amino acid aromatic metabolism. All these results suggest differences in gut immunity modulation, closely related to resilience. Conclusions This is the first study to show that selection for V-E of LS can shift the gut microbiome composition. The results revealed differences in microbiome composition related to gut immunity modulation, which could contribute to the differences in resilience among rabbit populations. The selection-driven shifts in gut microbiome composition should make a substantial contribution to the remarkable genetic response observed in the V-E rabbit populations.
Palabras clave
Indicios de calidad
Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión
El trabajo ha sido publicado en la revista Microbiome debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2023, se encontraba en la posición 8/161, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Microbiology. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.
Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir de las Citas Mundiales proporcionadas por WoS (ESI, Clarivate), arroja un valor para la normalización de citas relativas a la tasa de citación esperada de: 2.72. Esto indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: ESI 14 Nov 2024)
Esta información viene reforzada por otros indicadores del mismo tipo, que aunque dinámicos en el tiempo y dependientes del conjunto de citaciones medias mundiales en el momento de su cálculo, coinciden en posicionar en algún momento al trabajo, entre el 50% más citados dentro de su temática:
- Media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 1.36 (fuente consultada: FECYT Feb 2024)
- Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions: 7.38 (fuente consultada: Dimensions Jul 2025)
De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-07-26, el siguiente número de citas:
- WoS: 14
- Scopus: 9
- Europe PMC: 8
Impacto y visibilidad social
Análisis de liderazgo de los autores institucionales
Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (CASTO REBOLLO, CRISTINA) y Último Autor (IBAÑEZ ESCRICHE, NOELIA).
el autor responsable de establecer las labores de correspondencia ha sido IBAÑEZ ESCRICHE, NOELIA.