{rfName}
To

Indexat a

Llicència i ús

Licencia Icono OpenAccess

Citacions

18

Altmetrics

Impacte en els Objectius de Desenvolupament Sostenible (ODS)

Anàlisi d'autories institucional

García-Garví, AntonioAutor o coautorPuchalt-Rodríguez, Joan CarlesAutor o coautorSanchez-Salmerón, AjAutor (correspondència)

Compartir

30 d’octubre de 2024
Publicacions
>
Article
Sí

Towards Lifespan Automation for Caenorhabditis elegans Based on Deep Learning: Analysing Convolutional and Recurrent Neural Networks for Dead or Live Classification

Publicat a: SENSORS. 21 (14): 1-17 - 2021-01-01 21(14), DOI: 10.3390/s21144943

Autors:

García-Garví, Antonio; Puchalt-Rodríguez, Joan Carles; Layana-Castro, Pablo Emmanuel; Navarro Moya, Francisco; Sánchez Salmerón, Antonio José
[+]

Afiliacions

Univ Politecn Valencia, Inst Automat & Informat Ind - Autor o coautor

Resum

The automation of lifespan assays with C. elegans in standard Petri dishes is a challenging problem because there are several problems hindering detection such as occlusions at the plate edges, dirt accumulation, and worm aggregations. Moreover, determining whether a worm is alive or dead can be complex as they barely move during the last few days of their lives. This paper proposes a method combining traditional computer vision techniques with a live/dead C. elegans classifier based on convolutional and recurrent neural networks from low-resolution image sequences. In addition to proposing a new method to automate lifespan, the use of data augmentation techniques is proposed to train the network in the absence of large numbers of samples. The proposed method achieved small error rates (3.54% +/- 1.30% per plate) with respect to the manual curve, demonstrating its feasibility.
[+]

Paraules clau

AnimalAnimalsAutomationCC. elegansC.-elegansCaenorhabditis elegansComputer visionConvolutionData augmentationDeep learningElegansError rateGood health and well-beingLife spanLifespan automationLongevityNeural networks, computerPetri dishPlate edgesRecurrent neural networksResolution imagesTraditional computers

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista SENSORS a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència Scopus (SJR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2021, es trobava a la posició , aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Instrumentation.

Independentment de l'impacte esperat determinat pel canal de difusió, és important destacar l'impacte real observat de la pròpia aportació.

Segons les diferents agències d'indexació, el nombre de citacions acumulades per aquesta publicació fins a la data 2026-04-10:

  • WoS: 7
  • Scopus: 4
  • Europe PMC: 3
[+]

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2026-04-10:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 15.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 15 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 2.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 4 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.
  • Assignació d'un Handle/URN com a identificador dins del Dipòsit en el Repositori Institucional: http://hdl.handle.net/10251/187404
Seguint amb l'impacte social del treball, és important destacar el fet que, pel seu contingut, pot ser assignat a la línia d'interès de ODS 3 - Good health and well-being, amb una probabilitat del 0% segons l'algoritme mBERT desenvolupat per Aurora University.
[+]

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Switzerland.

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (Garví, AG) i Últim Autor (Sánchez Salmerón, Antonio José).

l'autor responsable d'establir les tasques de correspondència ha estat Sánchez Salmerón, Antonio José.

[+]

Reconeixements vinculats a l’ítem

This study was supported by the Plan Nacional de I + D under the project RTI2018-094312B-I00 and by the European FEDER funds.
[+]