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Altmetrics

Impacto en los Objetivos de Desarrollo Sostenible (ODS)

Investigadores/as Institucionales

García-Garví, AntonioAutor o CoautorPuchalt-Rodríguez, Joan CarlesAutor o CoautorSanchez-Salmerón, AjAutor (correspondencia)

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30 de octubre de 2024
Publicaciones
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Artículo

Towards Lifespan Automation for Caenorhabditis elegans Based on Deep Learning: Analysing Convolutional and Recurrent Neural Networks for Dead or Live Classification

Publicado en: SENSORS. 21 (14): 1-17 - 2021-01-01 21(14), DOI: 10.3390/s21144943

Autores:

García-Garví, Antonio; Puchalt-Rodríguez, Joan Carles; Layana-Castro, Pablo Emmanuel; Navarro Moya, Francisco; Sánchez Salmerón, Antonio José
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Afiliaciones

Univ Politecn Valencia, Inst Automat & Informat Ind - Autor o Coautor

Resumen

The automation of lifespan assays with C. elegans in standard Petri dishes is a challenging problem because there are several problems hindering detection such as occlusions at the plate edges, dirt accumulation, and worm aggregations. Moreover, determining whether a worm is alive or dead can be complex as they barely move during the last few days of their lives. This paper proposes a method combining traditional computer vision techniques with a live/dead C. elegans classifier based on convolutional and recurrent neural networks from low-resolution image sequences. In addition to proposing a new method to automate lifespan, the use of data augmentation techniques is proposed to train the network in the absence of large numbers of samples. The proposed method achieved small error rates (3.54% +/- 1.30% per plate) with respect to the manual curve, demonstrating its feasibility.
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Palabras clave

AnimalAnimalsAutomationCC. elegansC.-elegansCaenorhabditis elegansComputer visionConvolutionData augmentationDeep learningElegansError rateGood health and well-beingLife spanLifespan automationLongevityNeural networks, computerPetri dishPlate edgesRecurrent neural networksResolution imagesTraditional computers

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista SENSORS debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia Scopus (SJR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2021, se encontraba en la posición , consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Instrumentation.

Independientemente del impacto esperado determinado por el canal de difusión, es importante destacar el impacto real observado de la propia aportación.

Según las diferentes agencias de indexación, el número de citas acumuladas por esta publicación hasta la fecha 2026-04-05:

  • WoS: 7
  • Scopus: 4
  • Europe PMC: 3
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Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2026-04-05:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 15.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 15 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 2.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 4 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
  • Asignación de un Handle/URN como identificador dentro del Depósito en el Repositorio Institucional: http://hdl.handle.net/10251/187404
Siguiendo con el impacto social del trabajo, es importante enfatizar el hecho de que, por su contenido, puede ser asignado a la línea de interés del ODS 3 - Garantizar una vida sana y promover el bienestar para todos en todas las edades, con una probabilidad del 0% según el algoritmo mBERT desarrollado por Aurora University.
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Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Switzerland.

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (Garví, AG) y Último Autor (Sánchez Salmerón, Antonio José).

el autor responsable de establecer las labores de correspondencia ha sido Sánchez Salmerón, Antonio José.

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Reconocimientos ligados al ítem

This study was supported by the Plan Nacional de I + D under the project RTI2018-094312B-I00 and by the European FEDER funds.
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