{rfName}
Ch

Indexat a

Llicència i ús

Icono OpenAccess

Altmetrics

Anàlisi d'autories institucional

Sierra, SantiagoAutor o coautor

Compartir

8 defebrer de 2025
Publicacions
>
Article

Characterization of cassava ORANGE proteins and their capability to increase provitamin A carotenoids accumulation

Publicat a:Plos One. 17 (1): e0262412- - 2022-01-07 17(1), DOI: 10.1371/journal.pone.0262412

Autors: Jaramillo, Angelica M; Sierra, Santiago; Chavarriaga-Aguirre, Paul; Katherine Castillo, Diana; Gkanogiannis, Anestis; Becerra Lopez-Lavalle, Luis Augusto; Pablo Arciniegas, Juan; Sun, Tianhu; Li, Li; Welsch, Ralf; Boy, Erick; Alvarez, Daniel

Afiliacions

Alliance Biovers Int, Cali, Colombia - Autor o coautor
Alliance Biovers Int, HarvestPlus, Cali, Colombia - Autor o coautor
Cornell Univ, Robert W Holley Ctr Agr & Hlth, USDA ARS, Ithaca, NY USA - Autor o coautor
Int Ctr Trop Agr CIAT, Cali, Colombia - Autor o coautor
Int Food Policy Res Inst, HarvestPlus, Washington, DC 20036 USA - Autor o coautor
Univ Freiburg, Fac Biol 2, Freiburg, Germany - Autor o coautor
Veure més

Resum

Cassava (Manihot esculenta Crantz) biofortification with provitamin A carotenoids is an ongoing process that aims to alleviate vitamin A deficiency. The moderate content of provitamin A carotenoids achieved so far limits the contribution to providing adequate dietary vitamin A levels. Strategies to increase carotenoid content focused on genes from the carotenoids biosynthesis pathway. In recent years, special emphasis was given to ORANGE protein (OR), which promotes the accumulation of carotenoids and their stability in several plants. The aim of this work was to identify, characterize and investigate the role of OR in the biosynthesis and stabilization of carotenoids in cassava and its relationship with phytoene synthase (PSY), the rate-limiting enzyme of the carotenoids biosynthesis pathway. Gene and protein characterization of OR, expression levels, protein amounts and carotenoids levels were evaluated in roots of one white (60444) and two yellow cassava cultivars (GM5309-57 and GM3736-37). Four OR variants were found in yellow cassava roots. Although comparable expression was found for three variants, significantly higher OR protein amounts were observed in the yellow varieties. In contrast, cassava PSY1 expression was significantly higher in the yellow cultivars, but PSY protein amount did not vary. Furthermore, we evaluated whether expression of one of the variants, MeOR_X1, affected carotenoid accumulation in cassava Friable Embryogenic Callus (FEC). Overexpression of maize PSY1 alone resulted in carotenoids accumulation and induced crystal formation. Co-expression with MeOR_X1 led to greatly increase of carotenoids although PSY1 expression was high in the co-expressed FEC. Our data suggest that posttranslational mechanisms controlling OR and PSY protein stability contribute to higher carotenoid levels in yellow cassava. Moreover, we showed that cassava FEC can be used to study the efficiency of single and combinatorial gene expression in increasing the carotenoid content prior to its application for the generation of biofortified cassava with enhanced carotenoids levels.

Paraules clau

Beta-caroteneBiofortificatioBiosynthetic pathwaysCarotenoidsDown-regulationDry-matterGeneGene expression regulation, plantGenes, plantGeranylgeranyl-diphosphate geranylgeranyltransferaseLow-incomeManihotPhytoene-synthasePlant proteinsPlant rootsPostharvest storageProvitaminsSweet-potatoVitamin aVitamin-a status

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Plos One a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència Scopus (SJR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2022, es trobava a la posició , aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Multidisciplinary. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Des d'una perspectiva relativa, i atenent a l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir del Field Citation Ratio (FCR) de la font Dimensions, proporciona un valor de: 5.83, el que indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: Dimensions Sep 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2025-09-07, el següent nombre de cites:

  • WoS: 10
  • Europe PMC: 8

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2025-09-07:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 40.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 40 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 11.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 3 (Altmetric).
  • El nombre de mencions a mitjans de comunicació: 1 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Colombia; Germany; United States of America.