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Sierra, SantiagoAutor o Coautor

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8 de febrero de 2025
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Artículo

Characterization of cassava ORANGE proteins and their capability to increase provitamin A carotenoids accumulation

Publicado en:Plos One. 17 (1): e0262412- - 2022-01-07 17(1), DOI: 10.1371/journal.pone.0262412

Autores: Jaramillo, Angelica M; Sierra, Santiago; Chavarriaga-Aguirre, Paul; Katherine Castillo, Diana; Gkanogiannis, Anestis; Becerra Lopez-Lavalle, Luis Augusto; Pablo Arciniegas, Juan; Sun, Tianhu; Li, Li; Welsch, Ralf; Boy, Erick; Alvarez, Daniel

Afiliaciones

Alliance Biovers Int, Cali, Colombia - Autor o Coautor
Alliance Biovers Int, HarvestPlus, Cali, Colombia - Autor o Coautor
Cornell Univ, Robert W Holley Ctr Agr & Hlth, USDA ARS, Ithaca, NY USA - Autor o Coautor
Int Ctr Trop Agr CIAT, Cali, Colombia - Autor o Coautor
Int Food Policy Res Inst, HarvestPlus, Washington, DC 20036 USA - Autor o Coautor
Univ Freiburg, Fac Biol 2, Freiburg, Germany - Autor o Coautor
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Resumen

Cassava (Manihot esculenta Crantz) biofortification with provitamin A carotenoids is an ongoing process that aims to alleviate vitamin A deficiency. The moderate content of provitamin A carotenoids achieved so far limits the contribution to providing adequate dietary vitamin A levels. Strategies to increase carotenoid content focused on genes from the carotenoids biosynthesis pathway. In recent years, special emphasis was given to ORANGE protein (OR), which promotes the accumulation of carotenoids and their stability in several plants. The aim of this work was to identify, characterize and investigate the role of OR in the biosynthesis and stabilization of carotenoids in cassava and its relationship with phytoene synthase (PSY), the rate-limiting enzyme of the carotenoids biosynthesis pathway. Gene and protein characterization of OR, expression levels, protein amounts and carotenoids levels were evaluated in roots of one white (60444) and two yellow cassava cultivars (GM5309-57 and GM3736-37). Four OR variants were found in yellow cassava roots. Although comparable expression was found for three variants, significantly higher OR protein amounts were observed in the yellow varieties. In contrast, cassava PSY1 expression was significantly higher in the yellow cultivars, but PSY protein amount did not vary. Furthermore, we evaluated whether expression of one of the variants, MeOR_X1, affected carotenoid accumulation in cassava Friable Embryogenic Callus (FEC). Overexpression of maize PSY1 alone resulted in carotenoids accumulation and induced crystal formation. Co-expression with MeOR_X1 led to greatly increase of carotenoids although PSY1 expression was high in the co-expressed FEC. Our data suggest that posttranslational mechanisms controlling OR and PSY protein stability contribute to higher carotenoid levels in yellow cassava. Moreover, we showed that cassava FEC can be used to study the efficiency of single and combinatorial gene expression in increasing the carotenoid content prior to its application for the generation of biofortified cassava with enhanced carotenoids levels.

Palabras clave

Beta-caroteneBiofortificatioBiosynthetic pathwaysCarotenoidsDown-regulationDry-matterGeneGene expression regulation, plantGenes, plantGeranylgeranyl-diphosphate geranylgeranyltransferaseLow-incomeManihotPhytoene-synthasePlant proteinsPlant rootsPostharvest storageProvitaminsSweet-potatoVitamin aVitamin-a status

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Plos One debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia Scopus (SJR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2022, se encontraba en la posición , consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Multidisciplinary. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir del Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions, arroja un valor de: 5.82, lo que indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: Dimensions Sep 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-09-08, el siguiente número de citas:

  • WoS: 10
  • Europe PMC: 8

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-09-08:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 40.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 40 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 11.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 3 (Altmetric).
  • El número de menciones en medios de comunicación: 1 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Colombia; Germany; United States of America.