{rfName}
Sy

Indexat a

Llicència i ús

Icono OpenAccess

Citacions

14

Altmetrics

Compartir

14 d’abril de 2025
Publicacions
>
Article
Sí

Syn-tasiR-VIGS: virus-based targeted RNAi in plants by synthetic trans-acting small interfering RNAs derived from minimal precursors

Publicat a: NUCLEIC ACIDS RESEARCH. 53 (5): gkaf183- - 2025-03-19 53(5), DOI: 10.1093/nar/gkaf183

Autors:

Cisneros, AE; Alarcia, A; Llorens-Gámez, JJ; Puertes, A; Juárez-Molina, M; Primc, A; Carbonell, A
[+]

Afiliacions

Heidelberg Univ, Ctr Organismal Studies COS, D-69120 Heidelberg, Germany - Autor o coautor
Univ Politecn Valencia, Inst Biol Mol & Celular Plantas, Consejo Super Invest Cient, Valencia 46022, Spain - Autor o coautor

Resum

Synthetic trans-acting small interfering RNAs (syn-tasiRNAs) are 21-nucleotide (nt) small RNAs designed to silence plant transcripts with high specificity. Their use as biotechnological tools for functional genomics and crop improvement is limited by the need to transgenically express long TAS precursors to produce syn-tasiRNAs in vivo. Here, we show that authentic and highly effective syn-tasiRNAs can be produced from minimal, non-TAS precursors consisting of a 22-nt endogenous microRNA target site, an 11-nt spacer, and the 21 nt syn-tasiRNA sequence(s). These minimal precursors, when transgenically expressed in Arabidopsis thaliana and Nicotiana benthamiana, generated highly phased syn-tasiRNAs that silenced one or multiple plant genes with high efficacy. Remarkably, minimal but not full-length TAS precursors produced authentic syn-tasiRNAs and induced widespread gene silencing in N. benthamiana when expressed from an RNA virus, which can be applied by spraying infectious crude extracts onto leaves in a transgene-free manner. This strategy, named syn-tasiRNA-based virus-induced gene silencing (syn-tasiR-VIGS), was further used to vaccinate plants against a pathogenic virus, resulting in complete plant immunization. Our results reveal that syn-tasiRNA precursors can be significantly shortened without compromising silencing efficacy, and that syn-tasiR-VIGS represents a versatile, scalable, and nontransgenic platform for precision RNA interference and antiviral vaccination in plants.
[+]

Paraules clau

Artificial micrornasCloningDclDicer-like proteinsFunctionalityGenesMirnasSirna biogenesisSiteVectors

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista NUCLEIC ACIDS RESEARCH a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2025, es trobava a la posició 13/320, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Biochemistry & Molecular Biology. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Independentment de l'impacte esperat determinat pel canal de difusió, és important destacar l'impacte real observat de la pròpia aportació.

Segons les diferents agències d'indexació, el nombre de citacions acumulades per aquesta publicació fins a la data 2026-04-02:

  • WoS: 6
  • Scopus: 6
[+]

Impacte i visibilitat social

Des de la dimensió d'influència o adopció social, i prenent com a base les mètriques associades a les mencions i interaccions proporcionades per agències especialitzades en el càlcul de les denominades "Mètriques Alternatives o Socials", podem destacar a data 2026-04-02:

  • L'ús, des de l'àmbit acadèmic evidenciat per l'indicador de l'agència Altmetric referit com a agregacions realitzades pel gestor bibliogràfic personal Mendeley, ens dona un total de: 25.
  • L'ús d'aquesta aportació en marcadors, bifurcacions de codi, afegits a llistes de favorits per a una lectura recurrent, així com visualitzacions generals, indica que algú està fent servir la publicació com a base del seu treball actual. Això pot ser un indicador destacat de futures cites més formals i acadèmiques. Aquesta afirmació està avalada pel resultat de l'indicador "Capture", que aporta un total de: 23 (PlumX).

Amb una intenció més de divulgació i orientada a audiències més generals, podem observar altres puntuacions més globals com:

  • El Puntuació total de Altmetric: 28.
  • El nombre de mencions a la xarxa social X (abans Twitter): 33 (Altmetric).

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.
[+]

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: Germany.

Hi ha un lideratge significatiu, ja que alguns dels autors pertanyents a la institució apareixen com a primer o últim signant, es pot apreciar en el detall: Primer Autor (Cisneros, Adriana E) i Últim Autor (CARBONELL, ALBERTO).

l'autor responsable d'establir les tasques de correspondència ha estat CARBONELL, ALBERTO.

[+]

Reconeixements vinculats a l’ítem

ThisworkwassupportedbygrantsorfellowshipsfromMCIN/AEI/10.13039/501100011033and/orbythe 'EuropeanUnionNextGenerationEU/PRTR'[PID2021-122186OB-100,CNS2022-135107andRYC-2017-21648toA.C.;PRE2019-088439,PRE2022-102565,andPRE2022-103177toA.E.C.,J.L.G.,andM.J.M,respectively],fromConsejoSuperiordeInvestigacionesCientificas(CSIC,Spain)[JAEINT_20_01312toA.P.E.],andfromEuropeanCommission[Erasmus+GrantAgreement2020-1-DE01-KA103-005653toA.P.]
[+]