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14 de abril de 2025
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Syn-tasiR-VIGS: virus-based targeted RNAi in plants by synthetic trans-acting small interfering RNAs derived from minimal precursors

Publicado en: NUCLEIC ACIDS RESEARCH. 53 (5): gkaf183- - 2025-03-19 53(5), DOI: 10.1093/nar/gkaf183

Autores:

Cisneros, AE; Alarcia, A; Llorens-Gámez, JJ; Puertes, A; Juárez-Molina, M; Primc, A; Carbonell, A
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Afiliaciones

Heidelberg Univ, Ctr Organismal Studies COS, D-69120 Heidelberg, Germany - Autor o Coautor
Univ Politecn Valencia, Inst Biol Mol & Celular Plantas, Consejo Super Invest Cient, Valencia 46022, Spain - Autor o Coautor

Resumen

Synthetic trans-acting small interfering RNAs (syn-tasiRNAs) are 21-nucleotide (nt) small RNAs designed to silence plant transcripts with high specificity. Their use as biotechnological tools for functional genomics and crop improvement is limited by the need to transgenically express long TAS precursors to produce syn-tasiRNAs in vivo. Here, we show that authentic and highly effective syn-tasiRNAs can be produced from minimal, non-TAS precursors consisting of a 22-nt endogenous microRNA target site, an 11-nt spacer, and the 21 nt syn-tasiRNA sequence(s). These minimal precursors, when transgenically expressed in Arabidopsis thaliana and Nicotiana benthamiana, generated highly phased syn-tasiRNAs that silenced one or multiple plant genes with high efficacy. Remarkably, minimal but not full-length TAS precursors produced authentic syn-tasiRNAs and induced widespread gene silencing in N. benthamiana when expressed from an RNA virus, which can be applied by spraying infectious crude extracts onto leaves in a transgene-free manner. This strategy, named syn-tasiRNA-based virus-induced gene silencing (syn-tasiR-VIGS), was further used to vaccinate plants against a pathogenic virus, resulting in complete plant immunization. Our results reveal that syn-tasiRNA precursors can be significantly shortened without compromising silencing efficacy, and that syn-tasiR-VIGS represents a versatile, scalable, and nontransgenic platform for precision RNA interference and antiviral vaccination in plants.
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Palabras clave

Artificial micrornasCloningDclDicer-like proteinsFunctionalityGenesMirnasSirna biogenesisSiteVectors

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista NUCLEIC ACIDS RESEARCH debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2025, se encontraba en la posición 13/320, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Biochemistry & Molecular Biology. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.

Independientemente del impacto esperado determinado por el canal de difusión, es importante destacar el impacto real observado de la propia aportación.

Según las diferentes agencias de indexación, el número de citas acumuladas por esta publicación hasta la fecha 2026-04-02:

  • WoS: 6
  • Scopus: 6
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Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2026-04-02:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 25.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 23 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 28.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 33 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
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Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Germany.

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (Cisneros, Adriana E) y Último Autor (CARBONELL, ALBERTO).

el autor responsable de establecer las labores de correspondencia ha sido CARBONELL, ALBERTO.

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Reconocimientos ligados al ítem

ThisworkwassupportedbygrantsorfellowshipsfromMCIN/AEI/10.13039/501100011033and/orbythe 'EuropeanUnionNextGenerationEU/PRTR'[PID2021-122186OB-100,CNS2022-135107andRYC-2017-21648toA.C.;PRE2019-088439,PRE2022-102565,andPRE2022-103177toA.E.C.,J.L.G.,andM.J.M,respectively],fromConsejoSuperiordeInvestigacionesCientificas(CSIC,Spain)[JAEINT_20_01312toA.P.E.],andfromEuropeanCommission[Erasmus+GrantAgreement2020-1-DE01-KA103-005653toA.P.]
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