{rfName}
Wh

Indexat a

Llicència i ús

Icono OpenAccess

Citacions

14

Compartir

30 d’octubre de 2024
Publicacions
>
Article
Sí

Whole-Genome Identification of APX and CAT Gene Families in Cultivated and Wild Soybeans and Their Regulatory Function in Plant Development and Stress Response

Publicat a: Antioxidants. 11 (8): 1626- - 2022-08-01 11(8), DOI: 10.3390/antiox11081626

Autors:

Aleem, M; Aleem, S; Sharif, I; Aleem, M; Shahzad, R; Khan, MI; Batool, A; Sarwar, G; Farooq, J; Iqbal, A; Jan, BL; Kaushik, P; Feng, XZ; Bhat, JA; Ahmad, P
[+]

Afiliacions

Ayub Agr Res Inst, Agr Biotechnol Res Inst - Autor o coautor
Ayub Agr Res Inst, Cotton Res Stn - Autor o coautor
Barani Agr Res Stn - Autor o coautor
Chinese Acad Sci, Northeast Inst Geog & Agroecol, Key Lab Soybean Mol Design Breeding - Autor o coautor
GDC, Dept Bot - Autor o coautor
Jiangsu Univ, Int Genome Ctr, Zhenjiang 212013 - Autor o coautor
King Saud Univ, Dept Clin Pharm, Coll Pharm - Autor o coautor
Univ Agr Faisalabad, Ctr Adv Studies Agr & Food Secur CAS AFS - Autor o coautor
Univ Agr Faisalabad, Dept Plant Breeding & Genet - Autor o coautor
Univ Politecn Valencia, Inst Conservac & Mejora Agrodiversidad Valenciana - Autor o coautor
Veure més

Resum

Plants coevolved with their antioxidant defense systems, which detoxify and adjust levels of reactive oxygen species (ROS) under multiple plant stresses. We performed whole-genome identification of ascorbate peroxidase (APX) and catalase (CAT) families in cultivated and wild soybeans. In cultivated and wild soybean genomes, we identified 11 and 10 APX genes, respectively, whereas the numbers of identified CAT genes were four in each species. Comparative phylogenetic analysis revealed more homology among cultivated and wild soybeans relative to other legumes. Exon/intron structure, motif and synteny blocks are conserved in cultivated and wild species. According to the Ka/Ks value, purifying selection is a major force for evolution of these gene families in wild soybean; however, the APX gene family was evolved by both positive and purifying selection in cultivated soybean. Segmental duplication was a major factor involved in the expansion of APX and CAT genes. Expression patterns revealed that APX and CAT genes are differentially expressed across fourteen different soybean tissues under water deficit (WD), heat stress (HS) and combined drought plus heat stress (WD + HS). Altogether, the current study provides broad insights into these gene families in soybeans. Our results indicate that APX and CAT gene families modulate multiple stress response in soybeans.
[+]

Paraules clau

Ascorbate peroxidaseCatalase genesCatalyzeDroughtExpression patternsGG. maxG. sojaLeaf senescenceLegumesMaxPredictionSelectionSequenceSojaToleranceTranscription factors

Indicis de qualitat

Impacte bibliomètric. Anàlisi de la contribució i canal de difusió

El treball ha estat publicat a la revista Antioxidants a causa de la seva progressió i el bon impacte que ha aconseguit en els últims anys, segons l'agència WoS (JCR), s'ha convertit en una referència en el seu camp. A l'any de publicació del treball, 2022, es trobava a la posició 13/142, aconseguint així situar-se com a revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoria Food Science & Technology. Destacable, igualment, el fet que la revista està posicionada per sobre del Percentil 90.

Des d'una perspectiva relativa, i tenint en compte l'indicador de impacte normalitzat calculat a partir de les Citacions Mundials proporcionades per WoS (ESI, Clarivate), proporciona un valor per a la normalització de citacions relatives a la taxa de citació esperada de: 1.18. Això indica que, comparat amb treballs en la mateixa disciplina i en el mateix any de publicació, el situa com un treball citat per sobre de la mitjana. (font consultada: ESI 13 Nov 2025)

Aquesta informació es reforça amb altres indicadors del mateix tipus, que encara que dinàmics en el temps i dependents del conjunt de citacions mitjanes mundials en el moment del seu càlcul, coincideixen a posicionar en algun moment el treball, entre el 50% més citats dins de la seva temàtica:

  • Mitjana Ponderada de l'Impacte Normalitzat de l'agència Scopus: 1.16 (font consultada: FECYT Mar 2025)

Concretament, i atenent a les diferents agències d'indexació, aquest treball ha acumulat, fins a la data 2026-04-02, el següent nombre de cites:

  • WoS: 14
  • Scopus: 14
[+]

Impacte i visibilitat social

És fonamental presentar evidències que recolzin l'alineació plena amb els principis i directrius institucionals sobre Ciència Oberta i la Conservació i Difusió del Patrimoni Intel·lectual. Un clar exemple d'això és:

  • El treball s'ha enviat a una revista la política editorial de la qual permet la publicació en obert Open Access.
[+]

Anàlisi del lideratge dels autors institucionals

Aquest treball s'ha realitzat amb col·laboració internacional, concretament amb investigadors de: China; India; Pakistan; Saudi Arabia.

[+]